對于流域和濕地生態修復而言，水文起著決定性的影響。在時間尺度上，受到大氣環流和季風的影響，水文循環具有明顯的季節性變化規律，雨季和旱季徑流的交錯變化，洪水期與枯水期的有序輪替，是生態修復必須著重考慮的因素。在空間尺度上，對于大流域會存在著上中下游水文條件明顯差異，在流域內形成不同的生物區。河流的年度豐枯變化和洪水脈沖，直接影響流域和濕地的群落組成、結構功能以及生態過程。流域自然過程的低流量、高流量和脈沖流量，都是維持生物多樣性的基礎條件。低流量是大部分水生生物和常年淹沒的河濱植物生存所必不可少的基本條件，高流量有利于維持水生生物適宜的水文、溶解氧和水化學成分，增加水生生物適宜棲息地的數量和多樣性；洪水脈沖可為漂流性魚卵漂流、仔魚生長以及植物種子擴散提供合適的水流條件，洪水脈沖還抑制河口咸潮入侵，為河口和近海岸帶輸送營養物質、維持河口濕地和近海生物生存。

因此，流域和濕地生態修復技術具有以下特點：

①需要根據流域和濕地水文情勢，對水生態系統進行綜合規劃和系統整治，統籌協調保護與發展的相互關系，促進流域和濕地水生態系統的整體改善。

②需要推進人水和諧，通過建立生態護岸工程等建設，減少采砂等人類活動對水生態環境的破壞，通過沿岸營造植被緩沖帶或其他阻隔工程截留或隔斷農業面源污染，建構人水共榮共生環境。

③需要按照綜合規劃的水生境功能分區，對重點水域的水生境進行生態修復，開展棲息地的恢復、修復和再生工程，維持生物多樣性。

④需要對全流域重點水源涵養區進行生態保護修復，加強流域水土保持、退耕還林還湖還草，加強小流域綜合治理，有效遏制江河湖泊退化和濕地干涸萎縮退化的趨勢。